南京市第二医院(江苏省传染病医院，南京市公共卫生医疗中心），又名南京中医药大学附属南京医院，徐州医科大学南京第二临床学院，东南大学附属第二医院，南京市肿瘤医院。由宋美龄基金会创建于1933年，是集医疗、教学、科研、预防为一体，以“精专科、强综合、重防治、应突发”为特色的三级甲等传染病医院。医院先后荣获“全国卫生系统抗击非典先进集体”、“全国防治非典型肺炎工作先进基层党组织”、“人感染H7N9禽流感疫情防治工作中表现突出单位”、“国家埃博拉出血热疫情防控先进集体”、“全国抗击新冠肺炎疫情先进集体”、“全国先进基层党组织”等荣誉称号。
医院现分为钟阜院区、汤山院区两个院区，开放床位2000张。2020年门急诊量64.77万人次，出院病人4.1万人次。现有在职职工1609人，其中卫技人员1449人，高级职称人员281人，博士48人，硕士389人。有感染性疾病科1个国家临床重点专科，感染性疾病学、传染科、肿瘤科、妇产科、普通外科、肝病科、结核科7个江苏省重点学科、专科，中西医结合科1个江苏省示范中医科，肠道及其他传染病科、检验科、医学影像科、重症医学科、麻醉科5个南京市重点专科，中心实验室1个南京市医学重点实验室，国家中医药管理局重点研究室1个。有享受国务院政府特殊津贴专家8人，江苏省医学领军人才3人，省医学重点人才2人，省“333”工程人才12人，江苏省有突出贡献中青年专家和拔尖人才9人，江苏省“六大人才高峰”8人；南京市有突出贡献中青年专家和拔尖人才8人。有南京中医药大学、东南大学、南京大学等高等院校博导、硕导共78人。医院是国家级住院医师规范化培训基地，近五年获省、市级科研成果奖24项，承担国家自然科学基金12项、国家科技重大专项13项、省部级科研项目35项，获专利授权109项，编写专著32部，发表SCI及中华等核心及统计源期刊554余篇。
钟阜院区地处鼓楼区钟阜路1-1号，占地面积42亩，总建筑面积8万平方米。综合学科齐全，开设外科、妇产科、肿瘤科、呼吸科、胸外科、骨科、神经外科、心血管内科、中医科、重症医学科等40多个临床、医技科室，发展综合救治水平以支撑传染病患者的救治、反哺传染病科室的发展，常规开展肝硬化、肝癌、肺结核、肺癌、骨关节结核、脑积液的外科和介入手术，为传染病患者诊疗提供强有力的综合保障，同时为城北地区百姓提供全面、优质的综合医疗服务，医疗服务辐射至安徽、山东等邻近省份。
汤山院区位于江宁区汤山街道康复路1号，占地面积480亩，总建筑面积10.9万平方米，开放床位1077张。是江苏省传染病紧急医学救援基地，南京市艾滋病、结核病定点收治医疗单位，是以消化道与呼吸道、接触性与非接触性等病种专科特色精细诊疗为主、综合诊疗为辅，集防治、救援、应急为一体的，南京市重大公共卫生事件应急救治中心。设有感染病科、结核科、肝病科、综合内外科、重症医学科、胰腺炎诊疗中心、一期临床研究中心等10多个临床、医技科室，竭力为南京地区的传染病患者服务，并为城东地区百姓提供优质、温馨、舒适、便捷的诊疗服务，医疗服务辐射至全省及周边省市。
“精诚奉献，惠泽民生”。多年来，南京市第二医院始终坚持公益惠民的宗旨，持续提升社会效益。积极推进医联体建设，牵头全省12家传染病医院成立江苏肝健康联盟、传染病专科联盟，筹建全市感染性疾病、肿瘤专科联盟，发挥领头羊作用，引领全省传染病医院及相关学科的建设与发展。与六合区、江宁区、栖霞区、鼓楼区多家社区卫生服务中心建立紧密型医联体，下沉优势综合医疗资源，辐射周边地区，造福更多百姓。以担当社会责任为己任，积极承担SARS、人感染H5N1禽流感、甲型H1N1流感、人感染H7N9禽流感、埃博拉出血热等历次突发公共卫生应急事件的医疗救治任务，圆满完成2013年四川雅安地震抗震救灾、2014青奥会医疗保障等各项应急保障任务，积极参与塞拉利昂、桑给巴尔等非洲地区的国际医学援助活动，对口帮扶安徽、新疆、青海、西藏等地。
新冠肺炎疫情发生后，南京市第二医院作为省、市定点收治医院，在省市政府及省、市卫健委的有力领导下，迅速反应，从2020年1月19日收治南京首例新冠患者，到2021年南京禄口国际机场暴发与境外输入关职疫情，医院抽调感染病科、呼吸科、重症医学科、内科、肿瘤科、中医科、放射、检验、药剂等多学科人员组建救治梯队，集中一切资源力量，全力开展医疗救治。创新实施“分片包干、重点监测、一患一策、每日会诊、同步中医与心理治疗”的救治策略，阶段性实现了患者“零死亡”医务人员“零感染”的目标。同时，为有效提高疫情救治水平，根据省、市领导指示精神，完成了汤山院区应急板房一期工程建设项目，永久性扩建工程一期项目主体建筑均已封顶，预计2022年投入使用。
风劲帆扬，砥砺前行，如今的南京市第二医院，翻开崭新的一页。医院将进一步发展特色技术引领学科发展，提高综合服务能力。依托国家三级公立医院绩效考核，健全现代医院管理制度，提升精细化管理水平。合力建设学科高峰，争创国家级区域医疗中心，提升医院整体实力。加快市公共卫生医疗中心扩建工程建设，整体形成预防、治疗、研究、应急指挥和教学培训中心，进一步完善新发突发传染病防控，推动公共卫生体系的建立健全。
